Az együtt töltött éjszaka után Neytiri egy Pokoli Teherautó zajára ébred. A hatalmas jármű lerombolja a Hangok Fáját, a Na'Vi-k egyik legszentebb helyét. Neytiri megpróbálja felébreszteni Jake-t, de ő még az emberi testében van. Neyitri próbálja odábbhúzni Jake-t, és könyörög neki, hpgy ébredjen fel. Mikor Jake végre felébred, a jármű elé áll, hogy megállítsa azt. Egy pillanatra megáll, de Parker Selfridge parancséra tovább megy. Jake fog egy követ és felmászik a tejére, szétzúzza a kameráit, ezzel megbénítva a járművet. Jake és Neytiri visszasietnek az Otthonfához, ahol Jake megpróbálja rávenni az Omaticaya Klánt a költözésre. Megpróbálja elmagyárzni a törzsnek, hogy miért kell távozniuk, de mielőtt a lényegre térhetne, az ő és Grace Avatar-ja is összeseik, Quaritch visszahozta őket az emberi testükbe, miután rájött, hogy Jake törte össze a Pokoli Teherautó kameráit. Tsu'Tey ezt bizonyítékként veszi arra, hogy árulók, és megakarja ölni Jake-t, de Neytiri ismét megvédi.

Miután visszatértek emberi testükbe, Grace megpróbálja elmagyarázni Selfridge-nek, hogy a fák és a növények egy hatalmas hálozatot alkotnak, olyat mint az emberi agy idegei, és a Na'Vi-k minden ilyen információhoz hozzá tudnak férni, ezért nem szabad lednteni a fákat. Selfridge ad nekik még egy órát az Avatar-jaikban, hogy rávegyék őket a költözésre. Eytukan azonban megkötözteti őket, és utasítja az Omaticaya Klánt a felkészülésre. Quaritch hadserege gázbombákkal és gyújtórakétákkal támad. Mo'At kiszabadítja Jake-t és Grace-t, arra kéri őket, hogy segítsenek. Az RDA a fa gyökreiet célozza, ezzel az egész ráomlik a menekülő Na'Vi-kra. Eytukan meghalt, Jake próbálja vígasztalni Neytiri-t elutasítja és távozik a többi életben maradt Na'Vi-val együtt. A menekülés közben Jake-t és Grace-t ismét visszahozzák az emberi testükbe, majd börtönbe zárják őket, Norm Spellman-nalé együtt, aki megtámadott egy tengerészgyalogost. Trudy Chacon és Dr. Max Patel kimenekítik az Avatar csapatot a börtönből. Trudy elköti a Samson-ját és biztonságos helyre repülnek vele, de Quaritch tüzel rájuk. Nem sikerül megállítania őket, de Grace megsérül. A csapat Avatar gépeket szállít a Lelkek Fájának közelébe, ahova az Omaticaya Klán menekült.

Jake visszatér az Avatar testébe, amit az Omaticaya Klán az Otthonfa romjainál hagyott. Jake Banshee-ja megtalálja őt, addig repülnek amíg meg nem találják a Nagy Leonopteryx-ot, Jake ráugrik a hátára és Tsahaylu-t létesít vele, ezzel ő lesz a 6. Toruk Makto. Először megrémülnek a Na'Vi-k, ahogy látják őt berepülni a Lelkek Fájához. Neytiri már tudja, hogy Jake melletük áll, és hálás, hogy visszatért. Jake megkéri Mo'At-ot, hogy mentse meg Grace-t a haláltól. A Na'Vi-k megpróbálják átültetni a tudatát örökre az Avatar testébe Eywa segítségével, de a sérülései túl nagyok. Mielőtt eltávozik, közli Jake-kel, hogy látja Eywa-t, és most már vele van.